Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms