Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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