Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPHNQ9NQX3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms