Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPCPD1Q9NPB8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms