Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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