Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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