Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF17Q9BXT8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms