Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms