Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms