Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms