Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms