Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF2Q96GP6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms