Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms