Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF501Q96CX3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF501Q96CX3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms