Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCTD12Q96CX2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms