Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGDNQ8NEJ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGDNQ8NEJ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms