Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HJURPQ8NCD3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms