Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms