Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C17orf53Q8N3J3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf53Q8N3J3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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