Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VWDEQ8N2E2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWDEQ8N2E2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms