Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms