Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms