Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms