Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTR9Q6PD62 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms