Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP135Q66GS9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP135Q66GS9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms