Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHIC1Q5VXU3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHIC1Q5VXU3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHIC1Q5VXU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHIC1Q5VXU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms