Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSBN1Q5VWQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms