Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC93Q567U6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms