Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms