Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00303Q3SY05 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms