Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms