Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms