Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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