Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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