Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITSN1Q15811 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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