Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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