Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms