Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HDM1Q15032 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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