Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHROOM2Q13796 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms