Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPS1Q13098 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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