Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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