Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms