Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms