Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms