Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms