Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms