Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms