Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPEQ02224 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms