Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL23P55773 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL23P55773 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL23P55773 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCL23P55773 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCL23P55773 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL23P55773 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms