Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9AP51151 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms